Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCL23P55773 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCL23P55773 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCL23P55773 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCL23P55773 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCL23P55773 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCL23P55773 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCL23P55773 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCL23P55773 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCL23P55773 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCL23P55773 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCL23P55773 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCL23P55773 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCL23P55773 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCL23P55773 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCL23P55773 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCL23P55773 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCL23P55773 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCL23P55773 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCL23P55773 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL23P55773 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL23P55773 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL23P55773 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL23P55773 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL23P55773 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCL23P55773 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCL23P55773 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCL23P55773 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCL23P55773 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCL23P55773 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL23P55773 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL23P55773 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL23P55773 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL23P55773 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL23P55773 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCL23P55773 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL23P55773 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL23P55773 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL23P55773 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL23P55773 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL23P55773 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCL23P55773 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCL23P55773 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCL23P55773 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCL23P55773 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL23P55773 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL23P55773 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL23P55773 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL23P55773 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCL23P55773 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL23P55773 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL23P55773 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL23P55773 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL23P55773 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCL23P55773 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCL23P55773 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL23P55773 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL23P55773 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL23P55773 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL23P55773 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL23P55773 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL23P55773 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL23P55773 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCL23P55773 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCL23P55773 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL23P55773 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCL23P55773 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CCL23P55773 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCL23P55773 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCL23P55773 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCL23P55773 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCL23P55773 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCL23P55773 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCL23P55773 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCL23P55773 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL23P55773 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL23P55773 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL23P55773 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL23P55773 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL23P55773 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL23P55773 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL23P55773 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL23P55773 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL23P55773 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL23P55773 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL23P55773 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCL23P55773 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCL23P55773 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCL23P55773 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCL23P55773 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms