Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2DP55273 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2DP55273 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKN2DP55273 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms