Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP6P55212 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP6P55212 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP6P55212 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP6P55212 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP6P55212 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP6P55212 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP6P55212 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP6P55212 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP6P55212 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP6P55212 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP6P55212 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP6P55212 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP6P55212 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP6P55212 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP6P55212 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP6P55212 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP6P55212 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP6P55212 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP6P55212 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP6P55212 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP6P55212 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP6P55212 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP6P55212 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP6P55212 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP6P55212 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP6P55212 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP6P55212 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP6P55212 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP6P55212 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP6P55212 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP6P55212 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP6P55212 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP6P55212 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP6P55212 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP6P55212 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP6P55212 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP6P55212 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP6P55212 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP6P55212 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP6P55212 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP6P55212 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP6P55212 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP6P55212 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP6P55212 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP6P55212 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP6P55212 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP6P55212 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP6P55212 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP6P55212 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP6P55212 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP6P55212 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP6P55212 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP6P55212 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP6P55212 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP6P55212 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP6P55212 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP6P55212 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP6P55212 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP6P55212 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP6P55212 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP6P55212 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP6P55212 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP6P55212 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP6P55212 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CASP6P55212 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP6P55212 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP6P55212 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP6P55212 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP6P55212 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP6P55212 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP6P55212 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP6P55212 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP6P55212 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP6P55212 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP6P55212 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP6P55212 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP6P55212 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP6P55212 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP6P55212 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP6P55212 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP6P55212 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP6P55212 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP6P55212 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP6P55212 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP6P55212 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP6P55212 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP6P55212 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP6P55212 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP6P55212 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP6P55212 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP6P55212 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP6P55212 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP6P55212 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP6P55212 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP6P55212 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP6P55212 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP6P55212 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP6P55212 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP6P55212 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms