Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLTPP55058 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLTPP55058 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLTPP55058 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PLTPP55058 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLTPP55058 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLTPP55058 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLTPP55058 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLTPP55058 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLTPP55058 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLTPP55058 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLTPP55058 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLTPP55058 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLTPP55058 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLTPP55058 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLTPP55058 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLTPP55058 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLTPP55058 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLTPP55058 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLTPP55058 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLTPP55058 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLTPP55058 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLTPP55058 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLTPP55058 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLTPP55058 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLTPP55058 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLTPP55058 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PLTPP55058 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLTPP55058 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLTPP55058 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLTPP55058 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLTPP55058 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLTPP55058 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLTPP55058 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLTPP55058 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLTPP55058 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLTPP55058 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLTPP55058 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLTPP55058 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLTPP55058 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLTPP55058 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLTPP55058 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLTPP55058 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLTPP55058 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLTPP55058 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLTPP55058 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLTPP55058 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLTPP55058 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLTPP55058 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLTPP55058 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLTPP55058 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLTPP55058 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLTPP55058 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLTPP55058 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLTPP55058 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLTPP55058 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLTPP55058 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLTPP55058 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLTPP55058 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLTPP55058 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLTPP55058 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PLTPP55058 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLTPP55058 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLTPP55058 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLTPP55058 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLTPP55058 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLTPP55058 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLTPP55058 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLTPP55058 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLTPP55058 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLTPP55058 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLTPP55058 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLTPP55058 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLTPP55058 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLTPP55058 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLTPP55058 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLTPP55058 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLTPP55058 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLTPP55058 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLTPP55058 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLTPP55058 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLTPP55058 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLTPP55058 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLTPP55058 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLTPP55058 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLTPP55058 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLTPP55058 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLTPP55058 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLTPP55058 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLTPP55058 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLTPP55058 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLTPP55058 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLTPP55058 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLTPP55058 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLTPP55058 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLTPP55058 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLTPP55058 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLTPP55058 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PLTPP55058 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLTPP55058 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms