Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRISP1P54107 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRISP1P54107 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRISP1P54107 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms