Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIMK2P53671 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK2P53671 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms