Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNA3P52797 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNA3P52797 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EFNA3P52797 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms