Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF140P52738 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF140P52738 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF140P52738 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF140P52738 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms