Protein–RNA interactions for Protein: P52179

MYOM1, Myomesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM1P52179 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MYOM1P52179 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MYOM1P52179 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MYOM1P52179 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
MYOM1P52179 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MYOM1P52179 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MYOM1P52179 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MYOM1P52179 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
MYOM1P52179 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MYOM1P52179 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
MYOM1P52179 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MYOM1P52179 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MYOM1P52179 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MYOM1P52179 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
MYOM1P52179 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
MYOM1P52179 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MYOM1P52179 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.79■■■■□ 3
MYOM1P52179 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
MYOM1P52179 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MYOM1P52179 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
MYOM1P52179 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms