Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR4P51679 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR4P51679 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR4P51679 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR4P51679 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR4P51679 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR4P51679 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR4P51679 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR4P51679 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR4P51679 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR4P51679 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR4P51679 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR4P51679 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR4P51679 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR4P51679 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR4P51679 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR4P51679 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR4P51679 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR4P51679 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR4P51679 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR4P51679 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR4P51679 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR4P51679 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR4P51679 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR4P51679 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR4P51679 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCR4P51679 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR4P51679 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR4P51679 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR4P51679 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR4P51679 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR4P51679 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR4P51679 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR4P51679 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR4P51679 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR4P51679 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR4P51679 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR4P51679 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR4P51679 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR4P51679 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR4P51679 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR4P51679 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR4P51679 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR4P51679 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR4P51679 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR4P51679 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR4P51679 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR4P51679 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR4P51679 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR4P51679 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR4P51679 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR4P51679 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR4P51679 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR4P51679 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR4P51679 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR4P51679 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR4P51679 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCR4P51679 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR4P51679 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR4P51679 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR4P51679 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR4P51679 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR4P51679 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR4P51679 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR4P51679 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR4P51679 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR4P51679 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR4P51679 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR4P51679 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR4P51679 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR4P51679 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR4P51679 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR4P51679 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR4P51679 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR4P51679 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR4P51679 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR4P51679 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR4P51679 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR4P51679 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR4P51679 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR4P51679 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR4P51679 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR4P51679 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR4P51679 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR4P51679 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR4P51679 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR4P51679 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR4P51679 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR4P51679 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR4P51679 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR4P51679 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCR4P51679 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCR4P51679 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR4P51679 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR4P51679 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms