Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VASPP50552 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VASPP50552 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VASPP50552 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VASPP50552 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VASPP50552 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VASPP50552 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VASPP50552 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VASPP50552 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VASPP50552 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VASPP50552 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VASPP50552 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VASPP50552 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VASPP50552 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VASPP50552 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VASPP50552 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VASPP50552 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VASPP50552 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VASPP50552 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VASPP50552 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VASPP50552 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VASPP50552 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VASPP50552 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VASPP50552 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VASPP50552 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VASPP50552 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VASPP50552 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VASPP50552 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VASPP50552 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VASPP50552 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VASPP50552 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VASPP50552 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VASPP50552 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VASPP50552 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VASPP50552 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VASPP50552 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VASPP50552 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VASPP50552 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VASPP50552 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VASPP50552 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VASPP50552 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VASPP50552 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VASPP50552 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VASPP50552 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VASPP50552 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VASPP50552 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VASPP50552 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VASPP50552 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VASPP50552 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VASPP50552 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VASPP50552 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VASPP50552 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VASPP50552 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VASPP50552 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VASPP50552 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VASPP50552 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VASPP50552 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VASPP50552 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VASPP50552 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VASPP50552 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VASPP50552 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VASPP50552 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VASPP50552 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VASPP50552 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VASPP50552 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VASPP50552 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VASPP50552 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VASPP50552 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VASPP50552 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VASPP50552 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VASPP50552 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VASPP50552 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VASPP50552 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VASPP50552 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VASPP50552 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VASPP50552 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VASPP50552 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VASPP50552 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VASPP50552 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VASPP50552 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VASPP50552 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VASPP50552 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VASPP50552 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VASPP50552 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VASPP50552 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VASPP50552 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VASPP50552 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VASPP50552 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VASPP50552 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms