Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF6P49848 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF6P49848 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF6P49848 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF6P49848 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF6P49848 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF6P49848 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF6P49848 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF6P49848 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF6P49848 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF6P49848 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF6P49848 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF6P49848 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF6P49848 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF6P49848 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF6P49848 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF6P49848 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF6P49848 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF6P49848 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF6P49848 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF6P49848 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF6P49848 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF6P49848 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF6P49848 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF6P49848 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF6P49848 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF6P49848 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF6P49848 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF6P49848 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF6P49848 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF6P49848 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF6P49848 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF6P49848 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF6P49848 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF6P49848 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF6P49848 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF6P49848 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF6P49848 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF6P49848 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF6P49848 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF6P49848 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF6P49848 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF6P49848 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF6P49848 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF6P49848 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF6P49848 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF6P49848 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF6P49848 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF6P49848 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF6P49848 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF6P49848 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF6P49848 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF6P49848 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF6P49848 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF6P49848 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF6P49848 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF6P49848 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF6P49848 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF6P49848 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF6P49848 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF6P49848 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF6P49848 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF6P49848 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF6P49848 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF6P49848 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF6P49848 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF6P49848 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF6P49848 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF6P49848 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF6P49848 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF6P49848 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF6P49848 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF6P49848 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF6P49848 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF6P49848 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF6P49848 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF6P49848 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF6P49848 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF6P49848 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF6P49848 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF6P49848 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF6P49848 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF6P49848 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TAF6P49848 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TAF6P49848 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF6P49848 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF6P49848 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF6P49848 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF6P49848 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF6P49848 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF6P49848 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF6P49848 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF6P49848 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF6P49848 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF6P49848 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF6P49848 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF6P49848 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF6P49848 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF6P49848 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF6P49848 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms