Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VEGFCP49767 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VEGFCP49767 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
VEGFCP49767 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VEGFCP49767 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms