Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRIM1P49642 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRIM1P49642 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRIM1P49642 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRIM1P49642 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms