Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPFP49454 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPFP49454 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPFP49454 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPFP49454 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPFP49454 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPFP49454 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPFP49454 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPFP49454 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPFP49454 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPFP49454 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPFP49454 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPFP49454 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPFP49454 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPFP49454 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPFP49454 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPFP49454 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPFP49454 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPFP49454 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPFP49454 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPFP49454 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPFP49454 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPFP49454 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPFP49454 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CENPFP49454 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPFP49454 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPFP49454 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPFP49454 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPFP49454 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPFP49454 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPFP49454 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPFP49454 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPFP49454 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPFP49454 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPFP49454 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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CENPFP49454 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPFP49454 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPFP49454 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
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CENPFP49454 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPFP49454 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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CENPFP49454 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPFP49454 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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CENPFP49454 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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CENPFP49454 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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CENPFP49454 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPFP49454 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
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CENPFP49454 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPFP49454 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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CENPFP49454 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPFP49454 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPFP49454 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPFP49454 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
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CENPFP49454 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPFP49454 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPFP49454 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPFP49454 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPFP49454 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPFP49454 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPFP49454 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPFP49454 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPFP49454 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPFP49454 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPFP49454 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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