Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPIAP49247 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPIAP49247 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPIAP49247 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPIAP49247 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPIAP49247 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPIAP49247 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPIAP49247 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPIAP49247 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPIAP49247 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPIAP49247 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPIAP49247 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPIAP49247 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPIAP49247 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPIAP49247 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPIAP49247 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPIAP49247 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPIAP49247 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPIAP49247 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPIAP49247 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPIAP49247 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPIAP49247 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPIAP49247 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPIAP49247 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPIAP49247 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPIAP49247 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPIAP49247 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPIAP49247 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPIAP49247 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPIAP49247 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPIAP49247 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPIAP49247 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPIAP49247 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPIAP49247 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPIAP49247 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPIAP49247 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPIAP49247 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPIAP49247 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPIAP49247 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPIAP49247 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPIAP49247 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPIAP49247 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPIAP49247 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPIAP49247 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPIAP49247 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPIAP49247 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPIAP49247 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPIAP49247 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPIAP49247 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPIAP49247 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPIAP49247 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPIAP49247 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPIAP49247 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPIAP49247 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPIAP49247 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPIAP49247 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPIAP49247 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPIAP49247 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPIAP49247 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPIAP49247 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPIAP49247 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPIAP49247 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPIAP49247 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPIAP49247 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPIAP49247 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPIAP49247 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPIAP49247 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPIAP49247 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPIAP49247 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPIAP49247 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPIAP49247 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPIAP49247 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPIAP49247 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPIAP49247 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPIAP49247 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPIAP49247 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPIAP49247 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPIAP49247 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPIAP49247 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPIAP49247 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPIAP49247 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPIAP49247 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPIAP49247 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPIAP49247 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPIAP49247 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPIAP49247 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPIAP49247 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPIAP49247 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPIAP49247 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPIAP49247 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPIAP49247 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPIAP49247 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPIAP49247 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPIAP49247 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPIAP49247 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPIAP49247 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPIAP49247 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPIAP49247 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPIAP49247 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPIAP49247 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms