Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC1P48995 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC1P48995 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms