Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSNK1DP48730 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSNK1DP48730 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSNK1DP48730 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSNK1DP48730 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSNK1DP48730 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSNK1DP48730 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSNK1DP48730 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSNK1DP48730 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSNK1DP48730 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms