Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX2P48431 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX2P48431 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX2P48431 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX2P48431 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX2P48431 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX2P48431 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX2P48431 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX2P48431 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX2P48431 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX2P48431 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX2P48431 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX2P48431 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX2P48431 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX2P48431 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX2P48431 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX2P48431 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX2P48431 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX2P48431 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX2P48431 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX2P48431 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX2P48431 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX2P48431 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX2P48431 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX2P48431 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX2P48431 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX2P48431 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX2P48431 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX2P48431 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX2P48431 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX2P48431 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX2P48431 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX2P48431 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX2P48431 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX2P48431 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX2P48431 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX2P48431 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX2P48431 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX2P48431 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX2P48431 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX2P48431 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX2P48431 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX2P48431 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX2P48431 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX2P48431 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX2P48431 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX2P48431 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX2P48431 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX2P48431 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX2P48431 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX2P48431 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX2P48431 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX2P48431 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX2P48431 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX2P48431 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX2P48431 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX2P48431 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX2P48431 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX2P48431 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX2P48431 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX2P48431 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX2P48431 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX2P48431 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX2P48431 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX2P48431 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX2P48431 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX2P48431 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX2P48431 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX2P48431 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SOX2P48431 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX2P48431 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX2P48431 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX2P48431 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX2P48431 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX2P48431 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX2P48431 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX2P48431 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SOX2P48431 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX2P48431 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX2P48431 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX2P48431 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX2P48431 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX2P48431 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX2P48431 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX2P48431 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX2P48431 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX2P48431 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX2P48431 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms