Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRP43088 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTGFRP43088 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms