Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC1A4P43007 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC1A4P43007 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC1A4P43007 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC1A4P43007 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms