Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP2P42575 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP2P42575 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP2P42575 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP2P42575 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP2P42575 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP2P42575 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP2P42575 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP2P42575 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP2P42575 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP2P42575 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP2P42575 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP2P42575 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP2P42575 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP2P42575 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP2P42575 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP2P42575 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP2P42575 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP2P42575 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP2P42575 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP2P42575 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP2P42575 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP2P42575 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP2P42575 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP2P42575 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP2P42575 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP2P42575 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP2P42575 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP2P42575 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP2P42575 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP2P42575 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP2P42575 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP2P42575 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP2P42575 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP2P42575 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP2P42575 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP2P42575 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP2P42575 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP2P42575 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP2P42575 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP2P42575 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP2P42575 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP2P42575 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP2P42575 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP2P42575 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP2P42575 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP2P42575 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP2P42575 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP2P42575 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP2P42575 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP2P42575 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP2P42575 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP2P42575 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP2P42575 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP2P42575 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP2P42575 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP2P42575 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP2P42575 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP2P42575 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP2P42575 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP2P42575 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP2P42575 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP2P42575 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASP2P42575 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASP2P42575 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP2P42575 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP2P42575 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP2P42575 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP2P42575 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP2P42575 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP2P42575 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP2P42575 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP2P42575 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP2P42575 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP2P42575 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP2P42575 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP2P42575 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP2P42575 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP2P42575 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP2P42575 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP2P42575 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP2P42575 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP2P42575 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP2P42575 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP2P42575 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP2P42575 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP2P42575 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP2P42575 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP2P42575 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP2P42575 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP2P42575 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP2P42575 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP2P42575 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP2P42575 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP2P42575 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP2P42575 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP2P42575 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP2P42575 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP2P42575 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP2P42575 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms