Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTR1BP42025 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR1BP42025 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTR1BP42025 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms