Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC1P41238 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms