Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL3P36405 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL3P36405 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL3P36405 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL3P36405 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL3P36405 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL3P36405 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL3P36405 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL3P36405 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL3P36405 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL3P36405 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL3P36405 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL3P36405 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL3P36405 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL3P36405 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL3P36405 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL3P36405 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL3P36405 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL3P36405 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL3P36405 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL3P36405 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL3P36405 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL3P36405 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARL3P36405 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARL3P36405 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARL3P36405 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARL3P36405 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARL3P36405 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARL3P36405 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARL3P36405 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARL3P36405 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL3P36405 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL3P36405 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL3P36405 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL3P36405 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL3P36405 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL3P36405 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL3P36405 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL3P36405 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL3P36405 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL3P36405 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL3P36405 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL3P36405 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARL3P36405 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARL3P36405 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ARL3P36405 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARL3P36405 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARL3P36405 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARL3P36405 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARL3P36405 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARL3P36405 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL3P36405 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL3P36405 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL3P36405 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL3P36405 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL3P36405 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL3P36405 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ARL3P36405 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARL3P36405 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARL3P36405 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARL3P36405 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARL3P36405 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ARL3P36405 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL3P36405 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL3P36405 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL3P36405 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL3P36405 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL3P36405 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL3P36405 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL3P36405 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL3P36405 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL3P36405 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL3P36405 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL3P36405 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL3P36405 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL3P36405 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL3P36405 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL3P36405 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 857 ms