Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJC1P36383 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJC1P36383 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJC1P36383 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJC1P36383 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJC1P36383 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJC1P36383 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJC1P36383 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJC1P36383 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJC1P36383 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJC1P36383 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJC1P36383 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJC1P36383 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJC1P36383 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJC1P36383 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJC1P36383 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJC1P36383 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJC1P36383 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJC1P36383 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJC1P36383 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJC1P36383 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJC1P36383 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJC1P36383 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJC1P36383 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJC1P36383 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJC1P36383 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJC1P36383 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJC1P36383 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJC1P36383 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJC1P36383 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJC1P36383 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJC1P36383 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJC1P36383 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJC1P36383 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJC1P36383 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJC1P36383 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJC1P36383 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJC1P36383 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJC1P36383 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJC1P36383 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJC1P36383 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GJC1P36383 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJC1P36383 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJC1P36383 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJC1P36383 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJC1P36383 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJC1P36383 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJC1P36383 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJC1P36383 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJC1P36383 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJC1P36383 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GJC1P36383 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJC1P36383 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJC1P36383 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJC1P36383 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJC1P36383 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJC1P36383 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJC1P36383 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJC1P36383 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJC1P36383 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJC1P36383 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJC1P36383 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJC1P36383 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJC1P36383 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJC1P36383 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJC1P36383 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJC1P36383 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJC1P36383 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJC1P36383 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJC1P36383 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJC1P36383 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJC1P36383 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJC1P36383 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJC1P36383 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJC1P36383 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJC1P36383 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJC1P36383 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJC1P36383 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJC1P36383 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJC1P36383 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJC1P36383 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJC1P36383 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJC1P36383 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJC1P36383 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJC1P36383 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJC1P36383 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJC1P36383 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms