Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHI3L1P36222 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHI3L1P36222 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms