Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX11P35716 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX11P35716 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX11P35716 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX11P35716 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX11P35716 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX11P35716 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX11P35716 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX11P35716 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX11P35716 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX11P35716 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX11P35716 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX11P35716 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX11P35716 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX11P35716 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX11P35716 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX11P35716 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX11P35716 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX11P35716 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX11P35716 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX11P35716 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX11P35716 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX11P35716 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX11P35716 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX11P35716 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX11P35716 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX11P35716 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX11P35716 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX11P35716 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX11P35716 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX11P35716 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX11P35716 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX11P35716 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX11P35716 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX11P35716 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX11P35716 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX11P35716 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX11P35716 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX11P35716 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX11P35716 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX11P35716 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX11P35716 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX11P35716 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX11P35716 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX11P35716 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX11P35716 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX11P35716 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX11P35716 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX11P35716 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX11P35716 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX11P35716 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX11P35716 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX11P35716 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX11P35716 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX11P35716 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX11P35716 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX11P35716 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX11P35716 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX11P35716 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX11P35716 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX11P35716 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX11P35716 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX11P35716 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX11P35716 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX11P35716 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX11P35716 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX11P35716 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX11P35716 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX11P35716 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX11P35716 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX11P35716 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX11P35716 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX11P35716 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX11P35716 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX11P35716 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX11P35716 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX11P35716 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX11P35716 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX11P35716 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX11P35716 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX11P35716 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX11P35716 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX11P35716 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX11P35716 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX11P35716 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX11P35716 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX11P35716 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX11P35716 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX11P35716 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX11P35716 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX11P35716 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX11P35716 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX11P35716 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX11P35716 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX11P35716 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX11P35716 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX11P35716 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms