Protein–RNA interactions for Protein: P35625

TIMP3, Metalloproteinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3P35625 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TIMP3P35625 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMP3P35625 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMP3P35625 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMP3P35625 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms