Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD12P35452 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXD12P35452 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD12P35452 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms