Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCVRNP35243 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCVRNP35243 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCVRNP35243 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCVRNP35243 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCVRNP35243 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCVRNP35243 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCVRNP35243 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCVRNP35243 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCVRNP35243 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RCVRNP35243 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCVRNP35243 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCVRNP35243 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCVRNP35243 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCVRNP35243 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCVRNP35243 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCVRNP35243 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCVRNP35243 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RCVRNP35243 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCVRNP35243 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RCVRNP35243 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RCVRNP35243 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RCVRNP35243 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCVRNP35243 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCVRNP35243 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms