Protein–RNA interactions for Protein: P32971

TNFSF8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF8P32971 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF8P32971 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF8P32971 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF8P32971 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF8P32971 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF8P32971 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF8P32971 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF8P32971 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF8P32971 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF8P32971 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF8P32971 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF8P32971 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF8P32971 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF8P32971 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF8P32971 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF8P32971 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF8P32971 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF8P32971 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF8P32971 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF8P32971 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF8P32971 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms