Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGA1P29973 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNGA1P29973 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA1P29973 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNGA1P29973 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNGA1P29973 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms