Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD40LGP29965 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD40LGP29965 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD40LGP29965 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms