Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRABP1P29762 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms