Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBMS1P29558 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBMS1P29558 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBMS1P29558 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms