Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC5P28715 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC5P28715 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms