Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFS1P28331 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFS1P28331 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NDUFS1P28331 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms