Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTR1BP28222 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1BP28222 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR1BP28222 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms