Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNE1P24864 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCNE1P24864 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNE1P24864 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms