Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP5F1P24539 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP5F1P24539 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms