Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDHBP21953 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDHBP21953 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHBP21953 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms