Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD9P21926 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD9P21926 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD9P21926 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD9P21926 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD9P21926 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD9P21926 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CD9P21926 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD9P21926 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD9P21926 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD9P21926 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD9P21926 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD9P21926 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD9P21926 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD9P21926 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD9P21926 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD9P21926 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD9P21926 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD9P21926 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD9P21926 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD9P21926 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD9P21926 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD9P21926 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD9P21926 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD9P21926 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD9P21926 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD9P21926 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD9P21926 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD9P21926 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD9P21926 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD9P21926 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD9P21926 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD9P21926 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD9P21926 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD9P21926 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD9P21926 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD9P21926 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD9P21926 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD9P21926 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD9P21926 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD9P21926 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD9P21926 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CD9P21926 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD9P21926 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD9P21926 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD9P21926 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD9P21926 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD9P21926 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD9P21926 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD9P21926 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD9P21926 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD9P21926 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD9P21926 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD9P21926 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD9P21926 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD9P21926 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD9P21926 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD9P21926 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD9P21926 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD9P21926 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD9P21926 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD9P21926 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD9P21926 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD9P21926 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD9P21926 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD9P21926 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CD9P21926 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD9P21926 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD9P21926 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD9P21926 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD9P21926 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms