Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DPA1P20036 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLA-DPA1P20036 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DPA1P20036 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 344.3 ms