Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC2P18074 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC2P18074 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERCC2P18074 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC2P18074 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms