Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXB8P17481 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB8P17481 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB8P17481 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms