Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB3P14651 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXB3P14651 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms