Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA4P13612 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA4P13612 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA4P13612 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms