Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GP1BBP13224 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GP1BBP13224 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BBP13224 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms