Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FCER1AP12319 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FCER1AP12319 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FCER1AP12319 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCER1AP12319 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms